IBM X3650 M3(7945I01)是M2的继任者，支持至强5600和5500系列，并且扩展了内存和存储。这款x3650 M3标配一颗Intel Xeon E5506处理器，核心频率2.13GHz，四核共享4MB L3缓存，具备4.8GT/s的QPI总线。这款服务器最高可以支持2颗主频3.33GHz的六核心至强5600处理器。内存方面M3比M2更胜一筹，共提供了18个内存插槽，最大支持192GB DDR3 RDIMM 或 48GB DDR3 UDIMM，更加适合于虚拟化应用的需求，标配4GB DDR3。存储方面也进行了扩展，M3最多支持16个 2.5英寸热插拔SAS/SATA或固态硬盘驱动器，支持RAID 0/1，可选RAID5。网络方面集成双千兆以太网网卡， 电源为675W，可选冗余。
IBM X3650 M3(7945I01)管理功能非常丰富，包括IBM IMM, Virtual Media Key 用于可选的远程呈现支持、预测故障分析、诊断LED、光通路诊断、服务器自动重启、IBM Systems Director 和 IBM Systems Director Active Energy Manager、IBM ServerGuide，为企业降低后期管理的难度，降低TCO。该产品对于小型企业来说非常合适。
