“十五”期间，我国在操作系统和应用软件方面一直瞄准世界先进水平，充分利用现有的条件，坚持不懈，积极创新，形成了一大批具有良好应用前景的成果，极大地缩短了我国与世界发达国家的差距。
在操作系统方面，中软推出了Linux服务器操作系统。中软Linux服务器操作系统包括：中软Linux通用服务器操作系统V3.0与V3.1、中软LinuxV3.1安全服务器操作系统、中软Linux邮件服务器、中软LinuxNCV4.0服务器和中软高可用服务器等，已在国防、政府、税务、科研院所、企业、学校的应用工程中广泛应用。针对用户的需求在全面提升系统核心能力的同时，在硬件适配、软件兼容性、安全性、扩展性、稳定性、易用性、服务性能、中文等方面进行了大量的改进和优化工作；能够充分满足商务关键应用的平台需求。
此外，中标普华推出了面向通用服务器的操作系统版本。该产品在研发过程中坚持走集成创新与原始创新并举、以集成创新为主的技术路线，它融入了中标软件在操作系统领域的最新研发成果，针对用户的需求在全面提升系统核心能力的同时，在硬件适配、软件兼容性、安全性、扩展性、稳定性、易用性、服务性能、中文等方面进行了大量的改进和优化工作；能够充分满足商务关键应用的平台需求，适用于金融、证券、政府、电信、能源、教育等各领域。其所具备的强大的企业应用能力，体现出了当今Linux软件发展的最新水平。在研发过程中，中标普华Linux服务器比较了与同类产品的差距，进行充分的调研、分析；不断跟踪Linux的最新发展动态，充分利用、吸收开源软件的新技术；利用与Intel、Sun、Novell公司的技术合作优势，有选择性地吸收，实施创新性的开发，扩充对核心技术的掌握，最终为用户提供功能齐全、性能优秀、运行稳定、安全可靠和符合用户需求的桌面操作系统。
我国已经建立起较为完备的Linux产品体系，包括从企业级的应用产品到桌面级产品；从嵌入式Linux软件到支持Lin-ux的硬件产品和开发工具。初步形成了以专注中文Linux开发的中科红旗公司，开发Linux及其关键应用的中软公司(中标公司将继承中软的这部分业务)、共创开源公司，开发Lin-ux关键应用的永中科技、金山公司，开发支持Linux数据库的东软公司及开发核心商用的金蝶公司等一批聚集在Linux产业链各环节的软件企业。
我国在部分Linux软件产品领域的自主研发实现了突破，自主开发了红旗Linux、中软Linux等操作系统和基于Linux的RedOffice办公套件等产品。在服务器操作系统方面，完成了内部测试版本Kylin(“麒麟”操作系统)的技术开发，该系统在支持Linux二进制代码、安全性、中文和网络等核心技术上取得较大突破，拥有自主知识产权，已在部分单位试用，金山公司在中文Linux的移植工作上，开发完成了适用于中文Linux的新的跨平台文字排版引擎、表格计算引擎和动画播放引擎，并于2004年推出运行于中文Linux的金山WPS版本；在嵌入式软件平台方面，形成了面向通信、仪器控制和信息电器行业的嵌入式软件平台研发，支持一批重点龙头企业牵头的项目，如华为、中兴、普天、长城、一汽、东软等目标产品厂家和凯思、京成科银等嵌入式软件厂家，并初步形成了目标产品厂家和嵌入式软件厂家的联合态势。
我国Linux应用在服务器、嵌入式系统、互联网和信息安全等领域取得了突破性进展，智能手机、机顶盒、商用服务器、医疗器械等领域的应用软件开发已形成一定规模，商业应用和商业价值逐渐显现。
在应用软件方面，金山、永中均推出了Office办公软件。目前，永中Office在省级政府采购中所占份额居国产办公软件首位，已成功应用于江苏、吉林、新疆等十几家省级政府机关和农村中小学现代远程教育系统。而金山的WPSOf-fice2005研发历时3年，斥资3000余万元，500多万行代码被全部重新编写。它不仅能运行在Windows系统和Linux系统之上，而且从操作界面、文档格式、使用习惯到二次开发接口等实现了对微软Office的“深度兼容”，其中甚至包括对微软加密算法的兼容，用户使用时会发现其功能按钮、下拉菜单甚至标尺都与微软Office2003相似，同时可以与微软Office相互读取，实现“零时间”上手。WPS，无论对于企业还是国家，都具有战略意义。
