NVIDIA于4月7日宣布,由NVIDIA计算机科学家组成的特别工作组已正式加入COVID-19高性能计算联盟(COVID-19 High Performance Computing Consortium),该联盟由美国政府、工业界和学术界领导者组成,以利用全球最强大的高性能计算机资源加速研究。
该联盟旨在加速开发检测、控制和治疗新型冠状病毒的有效方法。它将通过提供30台超级计算机的访问权限来支持研究人员,这些超级计算机的计算性能超过400 petaflops。
NVIDIA团队拥有多个关键领域的专业知识,包括AI、超级计算、药物发现、分子动力学、基因组学、医学成像和数据分析。该团队由NVIDIA副总裁兼加速计算总经理Ian Buck领导。
Buck表示: “COVID-19高性能计算联盟就像是我们这个时代的阿波罗计划。只不过这次不是为了月亮而竞赛,而是为了我们人类自己而竞赛。GPU超级计算机就是此次计划的火箭飞船,科学知识就是它们的燃料。NVIDIA将帮助这些火箭以更快的速度飞行。”
“要取得进展,最关键的是需要结合三个基本要素——各专业领域的科学家、计算机科学家和高性能计算机。我们很荣幸能在这方面发挥我们的作用。”
NVIDIA工作组将通过以下方式为联盟提供帮助:
- 应用AI技术:NVIDIA将提供AI方面的专业知识,帮助联盟的科学团队吸收和处理更多的数据,从而能够在更短的时间内以更快的速度获取更好的见解。
- 加速科学:NVIDIA在分子生物学、医学成像、基因组学、计算流体力学和可视化领域拥有十多年的专业知识。
- 优化大规模计算:NVIDIA带来了优化超级计算机吞吐量的专业知识。优化性能和增加更多的计算资源一样重要——例如,在一台性能达330petaflops的系统上,20%的优化就是60petaflops,相当于世界上第4快的超级计算机的性能。
NVIDIA还将通过NVIDIA NGC(一个GPU加速软件中心)提供相关AI和生命科学软件应用程序的打包软件。
在NGC上,COVID-19的研究工具都是公开可用的,且经过优化,能够用于多种GPU平台,包括超级计算机、NVIDIA DGX系统、经NGC验证的服务器、公有云GPU实例和NVIDIA Quadro工作站GPU。
NVIDIA GPU被应用于众多超级计算机中,这些超级计算机已经为对抗COVID-19做出了贡献:
1,一个研究小组利用美国橡树岭国家实验室的Summit超级计算机,筛选识别了77种可能对治疗该病有效果的药物化合物。Summit是全球速度最快的超级计算机,由27,000多个NVIDIA GPU驱动,能够帮助研究人员将发现时间从几年缩短到几天。
2,德克萨斯大学奥斯汀分校(University of Texas at Austin)和美国国立卫生研究院(U.S. National Institutes of Health)的研究人员利用GPU绘制了首张病毒spike蛋白的3D原子尺度图,spike蛋白是病毒附着人类细胞的一个主要途径。定位spike蛋白对研究人员开发药物防止病毒感染人类细胞至关重要。
3,数十万玩家参与了一个名为Folding@Home的分布式计算网络,该网络使用蛋白质折叠来模拟病毒的分子结构。他们的356,000 个NVIDIA GPU贡献了1.5exaflops的计算性能。