过去的近两年时间以来,我们能清楚地看到信息技术在疫情防护方面发挥的重要作用。作为科技行业的观察者,我们看到高性能计算在天文地理、生物医疗、能源以及制造等多个行业,关系人们衣食住行以及经济生活的方方面面。
高性能计算说起来陌生,但每个人都在享受高性能计算发展的成果,高性能计算已是无处不在,以英特尔为代表的科技公司正在以不断创新的技术推动高性能在更多行业普及,让更多人享受到高性能计算带来的福祉。
超算助力人们抗击新冠病毒
对普通人而言,无论是疫情防控信息的传播,通信大数据行程卡的设置,信息技术对人们日常工作学习都非常重要。对于专业人员而言,特别是生物医疗行业的专家而言,无论是基因序列测量,还是疫苗研究,其背后都离不开先进的信息技术。
2021 CCF全国高性能计算学术年会上(以下简称“大会”),中国科学院院士、中国科学院生物物理研究所核酸生物学院重点实验室学术委员会主任陈润生表示,新冠肺炎出现以后,中国科学家仅用一周时间就完成了其完整序列测量,在此基础上,核酸疫苗生产商用几天甚至几个小时就设计出了疫苗,对抗击新冠肺炎起到了非常重要的作用。
陈润生院士谈及的是医疗大数据在疫情防控方面的价值,医疗大数据对于高性能计算系统的计算和存储要求都非常高,作为先进技术提供者和创新者的英特尔不断通过创新技术,让高性能计算能造福更多人。
大会上,英特尔公司市场营销集团副总裁、中国区行业解决方案部总经理梁雅莉在演讲中提到:“通过英特尔与客户、合作伙伴以及政府机构的紧密合作,患者护理得以改善,并加快了治疗和疫苗研发的速度。英特尔的产品与技术正在被诸多高性能计算研究中心采用,应用于分子动力学和模拟,以了解病毒结构并加速新冠相关药物的发现和治疗。”
英特尔为瑞金医院转化医学中心注入“加速度”
上海交通大学医学院附属瑞金医院是一所三级甲等医院,瑞金医院转化医学研究中心采用英特尔傲腾持久内存打造了高性能临床医学深度挖掘系统,瑞金医院转化医学国家重大科技基础设施(上海)生信大数据平台共同负责人吕纲表示,转化医学中心的建立对瑞金医院乃至整个中国的医学发展都意义非凡。
瑞金医院转化医学是中国第一个,也是截至目前中国唯一建成的国家级综合性转化医学中心,其重点研究方向聚焦肿瘤(包括白血病)、代谢性疾病和心脑血管疾病等领域,通过新型软硬件技术和生信分析方法的手段,对重大疾病研究、大型临床多组学研究以及突发公共卫生事件提供数据和计算支持,因此,瑞金医院转化医学中心构建了专门的超算中心。
从吕纲的介绍中了解到,转化中心涉及大量的生物信息数据分析工作,对IT基础设施要求十分严苛。英特尔傲腾持久内存具备低时延、高带宽、大容量、长寿命、非易失等特性,再加上专为该高性能存储硬件而设计的DAOS开源并行文件系统,最终搭建了出色的超算系统,并为高性能临床医学深度挖掘系统提供了新思路。
在新平台为转化中心的工作带来了许多变化。比如,原本做全基因组测序的计算过程需要近7天时间,而现在需要不到8个小时就可以完成,计算时间大幅缩短,意味着病人可以更早得到检测信息和分析结果,更早接受对应的治疗方案,有时候,这会是一场与死神赛跑的过程。
对于许多超算中心而言,它们对于更强的算力和更高的存储性能的追求似乎是无止境的,而这确实是很有必要的,据了解,瑞金医院的超算中心凭借强大性能让瑞金医院团队仅用 45天就完成了新冠病毒的基因测序、组装、变异分析等工作,并在Nature上发表了论文。
而这,都需要更快、更强的超算平台。
英特尔:推动超算普及化、普适化
高性能计算是一个引擎,它推动科技进步,加快科技发展步伐,支撑着一些构想。无论是病毒研究还是疫苗研发,无论是病理研究还是精准治疗,无论是天文观测还是气候预测,到处都有高性能计算的身影,高性能计算的发展会惠及到每个人,高性能计算不应该让人感到陌生。
梁雅莉表示,“将高性能计算做到普及化、普适化是我们应该努力的方向。技术永远不是最大的挑战,技术上有这么多具有聪明才智的工程师们、科学家们,总能够突破边界。但如何让高性能计算走入每个人的生活,而且让其可视化并被人们理解,这是一个很重要的方向。”
银行在利用高性能计算大数据模型做风险控制以及反欺诈, 制造企业利用高性能计算系统来设计性能更好的产品,铁路公司使用天气预报服务来避免脱轨,药剂师使用机器学习来查明药物中的有害成分,能源公司模拟工厂机械的使用寿命以改进操作和维护,高性能计算施展空间所处可见。
英特尔如何推动超算普及化和普适化的呢?
首先,英特尔有丰富全面的技术产品组合,涵盖通用计算CPU和专用GPU加速器,以及FPGA和ASIC,傲腾持久内存和E级计算分布式存储,还有高性能互连和安全方案,同时,英特尔具备将所有元素无缝地协同工作的能力,以提供更优的整体系统性能。
为降低开发者的开发难度和工作量,英特尔推出了OneAPI,利用OneAPI这种异构开发工具让开发者开发一次应用,能运行在多个不同的硬件设备上,并且能在不损失性能的前提下,给了开发者更高的便捷度和灵活性。
同时,在生态方面,英特尔会与行业合作伙伴一起努力,与合作伙伴一起做很多前沿索,过程中会碰到很多前无古人东西,需要与有创新和突破意识的合作伙伴一起去探索。