据国外媒体报道，苹果Mac App Shop开张第二日，就已经步入盗版者的视线，成为其主要目标。很多用户纷纷反映发现了Mac App Shop的安全漏洞。盗版者和苹果的专家就同时罗列出一串的漏洞，它们都可能使得这些程序被非法复制或共享。
苹果首席执行官乔布斯一直坚持称Mac App Shop的推出是创新性的，但是公司并未就安全性问题发布回应。Mac用户原本一直都可以购买软件并安装在自己的电脑上，但是现在苹果将采取这种新的系统以复制其在音乐和手机方面的成功。目前Mac App Shop内有1000多款程序可以下载，包括目前最畅销的游戏《愤怒的小鸟（Angry Birds）》。
其中一个漏洞只会影响到某些程序，包括《愤怒的小鸟》游戏。该漏洞包括可以对程序进行简单复制，并将付费程序的购买代码发布使得其可以免费使用。
另外，还有一个叫Hackulous的组织表示已经开发了一款名为“Kickback”的程序，用于击破App Store出售的任意一款软件的保护。不过，该组织之前曾破坏了iPhone和iPad的保护后表示不会在下个月之前发布“Kickback”。其发言人表示，“我们将在该商店正式站稳后再发布‘Kickback’，因为我们不想使应用程序的价值由此受到影响，也不想损害开发者的利益。“
尽管苹果的审查程序可以在一定程度上保证产品的安全性，但是业界人士认为已发现的漏洞也暴露了该系统的不足，他们建议苹果最好在检查过程中再次进行测试，舍弃哪些在这种简单的技术下看似有怀疑的程序。
之前苹果的审查模式也一直受到质疑，因为其审查过程并不透明，很多应用程序莫名其妙就被拒之门外了。最出名的一次是Google公司用于iPhone的Voice应用程序被拒绝了。虽然最终还是得到了批准，但是两家公司经历了历时不短的拉锯战。这中间还发生了一件事，中国的淘宝网上曾销售过总计50000个iTunes账户。
